1945 – Кижский погост объявлен государственным заповедником. Поставлена задача разработать мероприятия по переносу на прилегающую к нему территорию “уникальных памятников гражданской архитектуры (избы и хозяйственные строения)”.
1948-1960 – Проведена первая реставрация архитектурного ансамбля погоста. На о.Кижи перевезен первый памятник архитектуры – дом Ошевнева, с которого началось формирование историко-архитектурной экспозиции под отрытым небом (1951).
1961 – Создан отдел Государственного музея Карельской АССР в Кижском заповеднике.
1965 – На базе Кижского отдела Государственного музея Карельской АССР создан Государственный историко-архитектурный музей “Кижи”.
1969 – Государственный историко-архитектурный музей “КИЖИ” преобразован в Государственный историко-архитектурный и этнографический музей-заповедник “КИЖИ”.
1972 – Утвержден Генеральный план развития Музея-заповедника “Кижи”.
1977 – Утвержден проект детальной планировки Музея-заповедника “Кижи”.
1979-1981 – Проведены работы по противоаварийному инженерному укреплению Преображенской церкви: демонтирован иконостас, внутри церкви установлен «поддерживающий» металлический каркас.
1988 – На территории Кижского комплекса учрежден государственный зоологический заказник.
1990 – Решением ЮНЕСКО архитектурный ансамбль Кижского погоста включен в Список Всемирного культурного и природного наследия.
1993 – Постановлением Верховного совета Республики Карелия земли Кижского комплекса комплекса в пределах охраной зоны музея объявлены землями историко-культурного назначения, утвержден специальный режим использования этих земель и охраны памятников и природных ландшафтов в охранной зоне музея.
1993 – Указом Президента Российской Федерации музей-заповедник “Кижи” включен в Государственный свод особо ценных объектов культурного наследия народов Российской Федерации, памятники архитектуры Кижского комплекса отнесены к федеральной собственности.
1993-1997 – Расширение социокультурного пространства Музея-заповедника. Активизация освоения новых видов и форм деятельности в сфере охраны и использования историко-культурного наследия. Разработка Концепции реставрации Преображенской церкви, Концепция технической защиты Кижского Погоста. Создана единая Служба охраны Музея-заповедника «КИЖИ».
2001 – Приказом министра культуры Российской Федерации № 695 от 27 июля 2001 года Государственный историко-архитектурный и этнографический музей-заповедник “Кижи” принят в ведение Министерства Культуры Российской Федерации